Биологи Квинслендского университета (Австралия) обнаружили
около восьми тысяч новых микроорганизмов, относящихся к бактериям и археям, большинство
из которых относится к экстремофилам.
Большинство найденных одноклеточных — 98-99% — относится к
экстремофилам, то есть живут в условиях, не подходящих для жизни других
организмов. Они могут обитать в гидротермальных источниках, токсичных шахтных
водах и других водоемах с высокой соленостью, кислотностью или щелочностью.
Такие условия практически невозможно воспроизвести в лаборатории, поэтому
экстремофилы обычно непригодны для культивирования in vitro, то есть
выращивания в пробирках,
Для анализа видового состава таких бактерий и архей
исследователи используют методы метагеномики, при которых изучаются
многочисленные фрагменты ДНК, извлеченные из окружающей среды. Ученые получают
генетический материал сразу всех организмов, попавших в пробы, передает «Лента.ру»
со ссылкой на Science Alert.
При этом устанавливается нуклеотидные последовательности
частей нуклеиновых кислот, а компьютерные программы собирают из них целые
геномы, определяют функции отдельных генов и соотносят их с конкретными видами
микроорганизмов.
Всего было проанализировано 1500 образцов. Ученые обнаружили
ДНК, которые не соответствовали уже установленным и хранящимся в базах данных
геномам. Всего было найдено 7280 бактериальных и 623 археальных геномов. Они
относились к 20 новым типам микроорганизмов, в том числе бактериям SHA-109,
выделенными из фекалий бабуина и отходов пальмового масла, и роду
некультивируемых архей Uncultured Archaeal Phylum 2 из гидротермальных
источников.
