Учёные Новосибирского государственного университета приняли
участие в построении первой подробной 3D-модели вируса Зика российской компанией Visual Science, это сможет помочь учёным в разработке диагностики и вакцины против
лихорадки, вызываемой тропическим вирусом.
3D-вирус Зика является частью некоммерческого проекта
«Зоопарк вирусов», в рамках которого уже были созданы трёхмерные прототипы
вирусов иммунодефицита, гриппа AH1N1, лихорадки Эбола, папилломы и аденовируса.
Такие модели суммируют известную информацию о строении наиболее опасных и
распространенных вирусов человека и являются своего рода визуальными научными
обзорами.
Учёные НГУ участвовали в построении моделей отдельных
белков, а также анализировали научные данные о родственных вирусах, чтобы
разобраться, как разные компоненты Зики (белки, РНК, липидная мембрана)
располагаются в вирионе (вирусной частице).
«Вирус Зика относится к роду флавивирусов. Самые изученные
представители этого рода — вирусы желтой лихорадки, лихорадки Денге, клещевого
энцефалита. Наиболее надежный метод диагностики вирусных инфекций — определение
генетического материала вируса в крови больного (ПЦР), но для этого требуется
хорошо оборудованная лаборатория и квалифицированный персонал», — рассказала
сотрудник НГУ Анастасия Бакулина.
Анализ поверхностного белка E вируса Зика (который
на модели обозначен разными оттенками голубого цвета) на поверхности показал,
что он сильно напоминает соответствующий белок вируса лихорадки Денге. У них
отличается менее половины аминокислотных остатков в составе этих белков, причем
многие различающиеся участки либо спрятаны в мембране, либо закрыты
гликозилированием (на модели гликозилирование показано молекулами серого цветом
на поверхности вируса). Эксперименты показывают, что антитела против вирусов
Зика связываются с вирусом лихорадки Денге, и наоборот. Это делает задачу
диагностики более сложной.
Пока неясно, как именно Зика может вызывать микроцефалию, и
сотрудники лаборатории НГУ пытаются с этим разобраться. Есть подозрение, что
это связано с особыми свойствами поверхностного белка E. Если «испортить» этот
белок, внеся туда мутации, которые оставят вирус жизнеспособным, то может
получиться хорошая вакцина.
Фото: © visual-science.com