Разногласия между министерством и РАН возникли в марте текущего года, после вступления в силу поправок в закон о науке и научной деятельности, согласно которым правительство должно утверждать уставы академий наук. Академики разработали свой проект, а Минобрнауки представило модельный устав, в котором предусматривается создание наблюдательного совета из числа депутатов, представителей в Совете Федерации, российского правительства и ученых. Этот орган должен осуществлять стратегическое планирование работы РАН, с чем категорически не согласны академики.

По словам Фурсенко, академики должны учесть в уставах "простые и понятные вещи": вопросы закрепления федерального имущества за подведомственными академиям организациями, порядок и объемы предоставления субсидий из федерального бюджета на фундаментальные исследования (должен утверждаться правительством), а также персональную ответственность президентов академий за эффективность деятельности этих научных организаций. По словам Фурсенко, главы академий должны нести личную ответственность за успехи или неуспехи, как и министры, возглавляющие то или иное ведомство.