В 2011 году общая численность производителей байкальского омуля, зашедших в нерестовые реки, составила 3,6 миллиона экземпляров, что меньше среднемноголетнего уровня.
Как сообщает в государственном докладе о состоянии Байкала и его охране, подготовленном министерством природных ресурсов и экологии России, в реку Верхняя Ангара была зафиксирована самая низкая за последние 30 лет численность нерестового омуля, а в реку Баргузин, напротив, зашло рекордное за три десятилетия количество омуля — 600 тысяч экземпляров.
Состояние запасов основных промысловых рыб остается достаточно стабильным. Несмотря на многолетний запрет и проводимые мероприятия по искусственному воспроизводству, не наблюдается заметного увеличения запасов осетра. Основная причина — браконьерский вылов.
Сейчас омуль в нагульном стаде представлен рыбами промысловой длиной от восьми до 38 сантиметров в возрасте от одного до 19 лет; единично встречаются особи размерами до 50 сантиметров в возрасте до 24 лет.
В целом за последние 30 лет наблюдается тенденция увеличения линейно-весовых показателей омуля, стабилизация и даже улучшение некоторых биологических характеристик омуля. По сравнению с концом 70-х — началом 80-х годов, средние размеры пелагического и прибрежного омуля в последнее десятилетие увеличились на 8-9%, а придонно-глубоководного омуля на 17%.